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普美瑞:以AI算法助力生命科学

发布日期:2023-12-18  来源:常州日报  浏览次数:  字号:〖

12月15日上午10点,位于常州国家高新区的中国科学院遗传资源研发中心一间办公室内,AI算法总监陆旭峰正全神贯注对着两台电脑,随着其手下敲出的代码,显示器上跑出如“天书”般的算法程序。这与互联网公司相似的办公场景,是普美瑞(常州)生物科技有限公司的日常。

这家成立于2020年的高科技公司,致力于生物大分子结构相互作用的预测算法开发,其主要应用领域是创新药物与合成生物研发,已于2021年完成天使轮融资。

AI助力生命科学是一个正在快速发展的新兴领域,给制药行业带来了革命性进步。国内近年涌现的新锐企业都希望率先取得突破,完成新药首发。“作为行业上游企业,拥有对蛋白质结构的设计与改造能力,这是企业核心竞争力所在。”陆旭峰说。

在填补常州AI制药“原创”空白这一点上,普美瑞扮演着重要角色。与一般药企不同,普美瑞仅有10名员工。核心研发团队由海归博士组成,专业背景包括应用数学、药物化学、医学基因学等,形成了算法开发、算法应用、实验验证三大关键环节的研发闭环。在这里,“码农”比“白大褂”多,花在计算机上的时间比实验室长。

去年底,在蛋白质结构预测权威世界大赛CASP中,普美瑞技术顾问、首席科学家常珊教授团队获得蛋白/RNA-配体复合物结构预测赛道第一名,引发业内关注。凭借国际领先的预测能力,普美瑞将核心算法应用到了PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)分子设计平台,运用AI技术寻找攻克癌症的“钥匙”。

“通俗地说,我们用AI算法设计一个分子。这种分子进入人体内后,能够找到肿瘤驱动蛋白,把它们和E3泛素连接酶拉到一起,使肿瘤驱动蛋白被分解掉,不再留在体内。”常珊说,团队花费半年时间设计算法程序,并在3个月内完成了算法应用和实验验证,目前已在动物实验阶段。现有的实验结果表明,该分子针对结直肠癌、非角化型肺鳞癌和白血病的癌细胞,杀伤力与传统药物相当,且耐药性显著降低。

为让更多企业享受AI算法带来的革新成果,普美瑞自主研发了一站式生物计算平台——MOL-Turing云计算平台。技术顾问孔韧博士介绍,平台设计了蛋白—蛋白识别、靶标预测、小分子设计、抗体开发等在内的多个工具模块,能帮助企业在研发“卡脖子”问题上高效进行算法迭代,加快研发进度。

在药物、化工等领域,合成生物具有广泛应用前景。除了AI制药,普美瑞还与江苏理工学院合作开展合成生物学方向的研发项目,如重组蛋白设计、酶改造等。陆旭峰举例说,如果通过算法改进蛋白设计,实现重组乳铁蛋白的高效人工合成,人造牛奶的口感将大大提高。

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